在1990年代全球化的背景下，許多先進國家高等教育走向市場化，對教育內容、學科、課程、學術領域之發展產生不少衝擊，如高等教育企業化、學術資本主義、大學課程實用化、職業主義、與學科分化、人文社會科人數減少、大學學科支離破碎等。本文檢視近10年臺灣高等教育重要政策的主軸，發現政府對高等教育的管制正走向威權民粹主義式，原不應介入的教育外部事項，如學費等，也已經介入，並干預如課程、學術研究領域、系所發展等教育內部事項。如此與大學法長久以來強調的「學術自由」與「大學課程自主」理念，恐背道而馳。本文指出，市場化其實可與學術自由與大學自主的精神相結合，政府在市場化中應減少對內部不必要的管制，應積極保障不具立即實利性的課程與學術領域，使其免於成為市場化下的犧牲品，俾維護大學的人文價值。